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首先要考虑化学相容性，即滤膜是否耐酸、碱、有机溶剂等。具体参见(附页)化学相容性表。
1.滤膜的孔径：
*孔径0.45μm滤膜：用于常规样品流动相过滤，能够满足一般色谱要求。如：用于3μm或更大粒径填料的色谱系统。
*孔径0.22μm滤膜：能去除样品及流动相中极细颗粒的要求。如：用于<3μm填料的色谱系统。
*孔径1-5μm滤膜：常用于难以处理的浑浊溶液，可先以1-5μm滤膜预过滤，再用相应滤膜再过滤。
2.过滤样品的特性:
A：亲水样品：适宜选用亲水膜片，适用于过滤水为基质的溶液。如：自来水、地表水、可用滤膜为：水系膜(混合纤维素酯)、尼龙膜(聚酰胺)。
B：有机、无机化合物(醇类、酯类、油类)样品适用尼龙膜(聚酰胺)。
C：蛋白溶液样品：适用低蛋白吸附的滤膜。即PVDF膜。
D: 强酸强碱类样品适用疏水性PTFE(聚四氟乙烯膜)。
二.：
*外壳：高压聚丙烯(PP)耐高温，不泄漏，不需换膜和清洗，省去繁杂费时的准备工作
，是过滤HPLC、GC小量样品首选产品。
*滤器规格的选择：常用Φ13μm，Φ25μm两种，即样品量2-10ml选用Φ13μm，样品量10-100ml选用Φ25μm。
几种常用滤膜的特性及应用：
1.水系膜(混合纤维素酯CN-CA)
特性：孔径均匀，孔隙率高，无介质脱落，质地薄，阻力小，滤速快，成本低，但不耐有机溶液及强酸强碱。
应用：饮用水、地表水、井水等，除菌过滤，溶液中微粒及油类不溶物的分析，水质污染指数测定，气体、油类、饮料、酒等微粒和细菌过滤。为样品前处理过滤中最为广泛使用的滤膜之一。
2.尼龙膜(聚酰胺NYLON)
特性：耐温性能好，可耐121°C，饱和蒸汽高压消毒30分钟，最高工作温度60°C,化学稳定性好,能耐稀酸稀碱等多种有机无机化合物、溶剂。
应用：适用于电子、微电子、半导体工业水过滤，组织培养基、药液、饮料、高纯化学品、水及有机溶液流动相的过滤。
3.PVDF膜(聚偏氟乙烯)
特性：膜机械强度高，抗张强度好，具有良好的耐热性及化学稳定性，蛋白吸附极低，具较强的疏水性。
应用：气体及蒸汽过滤，高温液体过滤，组织培养基，添加剂等除菌过滤，溶剂和化学原料净化过滤。
4.PTFE(聚四氟乙烯)
特性：具有广泛的化学兼容性，耐温性好，抗强酸强碱，化学腐蚀性较强的溶剂及氧化剂。
应用：化工、医药、环保、电子、食品、能源等领域，几乎能过滤所有的有机溶液。
